（一）施用有机肥的原则
为了尽可能发挥有机肥的优点，避免其不良影响，应注意：
（1）施用有机肥后，氧气下垂曲线的临界点的溶氧量应在所养鱼种容许的溶氧底线以上。
（2）最好在第一次氧气下垂曲线转化点之后，才第二次使用有机肥。
（二）施用有机肥应注意的问题。
1.有机负荷高的水体，应以养殖耐缺氧、对病毒抵抗力强、食物链短的鱼种为主。
2.若所养鱼种一定，因而临界点也已经被限定时，要在现有养殖体制下，增加有机负荷而不产生危害，可考虑以下办法：
（1）人工强力增氧，提高水体自净能力。例如，使用增氧机械或制剂，实行流水养殖等。
（2）实行预处理，使第一阶段分解过程在鱼池外完成，例如，有机肥或污水，先经过沉淀、曝气、氧化塘等处理或沤制发酵、降解后，再放进鱼池。
（3)少量多次。要注意的是，尽管有机物可以直接、间接地充当水中动物的饵料，不过作为营养物质来说，只是间接的，它们的有效化要以消耗溶氧为代价。即使水中有机物较多，其矿化再生补给速度有限，水中营养元素有效形式的实际浓度仍然很低，供不应求，较好的解决这个问题，应将有机肥与无机肥配合使用。
